POZR, SPOILER
Alice se potuluje zničeným velkoměstem. Když se chce napít vody, je napadena nemrtvým a později jakousi létající potvorou. Pak ji kontaktuje Červená královna a tvrdí, že jí chce pomoci. Nechce již zničit lidstvo.
Na Zemi zbylo jen 4 472 lidí. Ty čeká smrt do dvou dnů. Umbrela prý vymyslela sérum, které definitivně ničí T-virus, ten je uložen v Racoon City, v úlu. Alice tam má jet. K tomu dostane jako bonus Weskera, proto se ihned vydává na cestu. Že nebude jednoduchá, se brzy přesvědčí, když padne do pasti u mostu. Probere se až v nějakém obrněném vozidle. Zde je i Isaac a ten ji z vozu vyhodí. Je připoutána na laně a uvázaná za vozidlo. Musí běžet, ale také i proto, že je za ní stádo zombií. Ale i zde si Alice poradí a ujíždí na motorce. Konečně se ocitá v Raccoon City, a to přímo u kráteru, který tehdy vytvořil onen výbuch. Alice se pak na motorce dopustí chyby.
Když se probere, je kolem houf lidí. Mimo jiné i Kristian, který chce Alici zabít, protože jí nedůvěřuje. Ale blíží se sem Isaac se zombiemi - a je třeba to řešit. Chystá se obrana, budují se pasti. A protože je benzínu dost, bude se používat oheň. Nastává bitva, ve které zombie hynou po stovkách, ale ztráty jsou i na druhé straně. Po tomto boji se Alice s dalšími šesti lidmi slaní do kráteru, kde je již čekají vlci. A ne obyčejní. Následuje útěk lidí až ke vstupu do úlu. Vlci dále nejdou, bojí se. Červená královna jim pustí záznam, který dokazuje, že únik T-viru byl naplánován, a to právě Isaacem. Upozorní soukromě Alici, že mezi těmi, co s nimi přišla, je asi zrádce.
Už prolézt větrákem působí potíže, a když se začne točit obráceně, jeho lopatky se stanou vražednou zbraní. Alice s Claire a dvěma muži přežili. Pokračují, ale padnou do pasti. Doslova se propadnou šachtami, ne však stejnými. Takže jsou nyní rozděleni. Alice je napadena monstrem, ale vítězí. Zde ji najde poslední přeživší muž a pokračují dále. Ocitají se v přístupové chodbě, kde kdysi laser nakrájel členy zvláštní jednotky. Pak sjíždějí na plošině do spodních pater. Zde je již očekává doktor Alexandr Roland Isaac, má u sebe látku, která má zachránit lidstvo. Je jasné, že ji nevydá jen tak. Zrádce se již projevil a nastává okamžik, kdy poví Alici celou pravdu a tím ukončí příběh. Tvrdí, že Alice je jen klon, pravá je za ní. A skutečně přijíždí žena na vozíku, vzhledově tak na šedesát let - Ališa Markusová, dcera profesora Jamese Maruse a tehdy Isaacova společníka. Jak víme, byl to on, kdo tehdy vymyslel lék pro nemocnou dcerku, která trpěla progerií. To je ta paní, která sem přijela na vozíku. Alice je jen její klon, ale zdravý klon. A ten se nyní musí bránit útoku.
Nakonec Alice vyváží plošinou nahoru onu látku, která je spasením. Musí ještě bojovat s nepřítelem a nakonec i sama se sebou. Látka totiž zabije i ty, kdo v sobě mají T-virus. A to Alice má...
